東海水產研究所圖書館創立于建所之初，1963 年遷入現址。館內收藏水產科學各專業中、外文期刊 400 多種，圖書5萬余冊。文獻主要涉及魚類學、水產養殖、海洋漁業及資源、水生生物學、漁業環境保護、水產品加工等專業和學科，可為水產科技工作者以及其它專業人員提供參考消息和相關信息。編輯印發《全球漁業信息》（原《世界漁業信息》）等內部參考資料。